（一）两者隶属类别不同

机电工程资质隶属于施工总承包资质，而建筑机电安装资质隶属于专业承包资质。前者可以承包独立的机电安装工程，后者则只能分包施工总承包工程中的机电安装工程。比如，开发商如果将一项工程按土建工程和机电工程分别发包，那么，这个机电工程就是一项独立的工程，只能发包给具备机电工程资质的企业；开发商如果将土建工程和机电工程作为一项工程发包给能做土建工程的施工总承包企业，施工总承包企业再将其中的机电工程分包出去，就可以分包给具备建筑机电安装资质的企业。

（二）两者资质标准不同

机电工程资质办理条件高于建筑机电安装资质，且业务范围大于建筑机电安装资质。以两者的三级资质为例，机电工程资质要求企业净资产800万以上，建筑机电安装资质净资产只需达到400万；办理机电工程资质所需的各类注册人员和技术人员几乎是建筑机电安装资质的两倍。从承担业务范围看，机电工程总包三级可承担单项合同额1500万元以下的各类机电工程的施工，而建筑机电安装专包三级只能承担单项合同额1000万元以下的各类建筑工程项目的设备、线路、管道的安装，非标准钢结构件的制作、安装。